Wie du beim Screen oben sehen kannst legt Win64 zwei Ordner für Programme an - einer für x64 (64-bit) und einer für x86 (32-bit) - bei der Installation von Programmen wird ausserdem praktisch immer schon das richtige Installationsverzeichnis vorgeschlagen.
Bei mir laufen sehr selten ma Programme nicht und wenn lass ich die inner VM laufen.